Pengasuh & Pimpinan Pondok : Drs. KH. Anang Azharie Alie, M.Pd.I & Hj. Nunung Haeriyah, S.Ag
Direktur Kesejahteraan Rumah Tangga dan Pemberdayaan Ekonomi : Hj. Nunung Haeriah, S.Ag
Direktur Tarbiyatul Mu'allimin Al-Islamiyah : Ust. Ahmad Ghiyats Fawwaz, M.A
Direktur Pengembangan Tahfidz & Qiro'ah : Usth. Layali Hilwa, Lc.
Sekretaris Pimpinan : Ust. Syahrullah, S.Pd.I

Pondok Pesantren Modern Al-Mizan 1 Kampus Putra:
Wakil Pengasuh : Ust. Fajrul Aziz Nawawi, S.Pd.I
Wakil Direktur TMI : Ust. Habib Masturi, S.Pd.I

Pondok Pesantren Modern Al-Mizan 2 Kampus Putri:
Wakil Pengasuh Al-Mizan 2 Putri : Ust. M. Badruddawam Syihab, M.Pd.
Wakil Direktur TMI : Ust. Abdul Mufid Setiabudi, M.Pd.I.

Pondok Pesantren Modern Al-Mizan 3 Program Tahfidzul Qur'an:
Wakil Pengasuh : Ust. Abdul Rochman Apif, S.Ag.
Wakil Direktur : Usth. Falita Ghorwa Jaliyya, B.Ed., M.A.