Program ekstrakurikuler di pondok pesantren modern al-mizan sangat beragam.
Tari Balet
Al-Mizan menyediakan tari balet agaar para santri mengenal dan mempertahankan tradisi negara Indonesia
Batik
Sebagai salah satau lembaga yang mendukung kesenian daerah di Al-Mizan para santri diajarkan juga bagaimana membuat motif Batik Indonesia.
Paduan Suara
Paduan suara putra dan putri merukapan ekskul bagi santriwan / santriwati yang memiliki hobby ditarik suara
Nasyid
Nasyid putra Al-Mizan
Marchin Band
Ponpes Al-Mizan menyediakan alat-alat marching band untuk para santri yang suka dibidang musik, dan marching band Al-Mizan sudah menjuarai beberapa lomba tingkas Nasional
Marawis
Marawis Putra Al-Mizan
Studio Band
Al-Mizan menyediakan studio band bagi para santri yang hobby di dunia musik, ekskul ini dipimpin langsung oleh ustadz senior
Basket Putri
Siapa bilang olahraga basket hanya untuk putra saja? di Al-Mizan putra ada loh ekskul basket untuk putri dan sudah menjuarai beberapa kompetisi daerah. Yuk mondok..!
Basket Putra
Tidak kalah dengan basket putri, Basket putra pun sering menjuarai lomba-lomba tingkat kabupaten
Tapak Suci
Ekstrakurikuler tapak suci merupakan ekskul yang paling banyak dimintai oleh para santriwan
Volley Putra
Al-Mizan menyediakan lapangan volley untuk para santriwan yang suka ekskul olahraga volley
Futsal
Al-Mizan menyediakan lapangan footsal untuk para santriwan yang suka ekskul olahraga footsal